Orbit Biosequenceではどのような種類の検索が可能か

変更日 金, 8 7月, 2022 で 3:08 午前


核酸配列またはアミノ酸配列は、Orbit Biosequence(OBS)プラットフォームで検索できます。 次の3種類の検索を使用できます。:


  • 「標準」配列検索では、ヌクレオチド長が約100以上、またはアミノ酸長が約30以上の配列を検索します。 

       ● この検索では、NCBI-BLASTアルゴリズムの最新バージョン(v2.7.1 +)を使用します。

  • 「短」配列検索では、ヌクレオチド長が100未満またはアミノ酸長が30 未満の配列を検索します。

       ● この検索では、NCBI-BLASTアルゴリズムの最新バージョン(v2.7.1 +)を使用します。これは、短い配列に適合するもので、[short input sequences]ボックスにチェックが入っているときに機能します。



  • 「MOTIF」検索は、配列内の特定のパターンまたはプロファイルを検索します。


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