Orbit Intelligence

Alignment Identity ％ アライメント一致率：アライメント長に対するマッチ率。例では、 63/(63+49)×100=56.2%   BLAST：Basic Local Alignment Search Toolの頭文字をとったもの。BLASTは、生物学的配列間の類似領域...

Orbit Biosequence（OBS）には、110万件の特許公報内の4億件以上の配列表データが含まれています。 特許公報の配列は、Genbank、EMBL、DDBJ、およびUS、EP、WO、JP、KR、CAの配列表から取得されます。 また、CN、WO、JP、KR、CA、FR、GB、IL、...

核酸配列またはアミノ酸配列は、Orbit Biosequence（OBS）プラットフォームで検索できます。 次の3種類の検索を使用できます。： 「標準」配列検索では、ヌクレオチド長が約100以上、またはアミノ酸長が約30以上の配列を検索します。　 　　　　　　　● この検索では、NCBI...

配列をFASTA形式でコピー＆貼り付けし（1つまたは複数の配列を同時に独立して検索できます）、配列の種類（タンパク質/ヌクレオチド）を選択します。 必要に応じて、アドバンスト・パラメータを開きます。 ー MOTIF検索を行う ー short input sequ...

短配列には、CDR、プライマー、酵素認識部位などがあります。 短配列を検索するには、以下の操作を行ってください： - FASTA形式で入力 - アドバンスト・パラメータを開く - [short input sequences］チェックする - e-valu...

配列をモチーフで検索できます。 CDR配列の基、特定のペプチドパターン、またはSNPの検索がこれまでになく簡単になりました。 Motif の書き方ルール 具体的に次の書き方があります： 文字と文字が一致するもの（以下のあいまい検索も使えます） .（ドット）任意の文字に置き換え ？前...

目次 TABLE OF CONTENTS 検索結果および検索された配列の確認 結果が出ない場合は、検索方法を確認してください %IDフィルターで結果を絞り込む 適切な割合(%)のIDとは... その他のフィルターについて OBS固有のカラムと表示についてはこちら アライメントタブ：配列のパワフ...

アライメントを読み取る 右側のパネルには、アライメントを表示するための新しいタブである[アライメント]タブ（1）が作成されています。 アライメントは検索されたクエリの配列（2）ごとに編成されます。 検索したクエリの配列ごとに、それぞれ一意の配列に一致するもののグラフィック表現が表示されます（3）。...

Orbit Intelligenceで使用できる通常のフィルターに加えて、8つのBioSequenceフィルターがあります。

配列検索で得られた結果のリストは、「表示」オプションをクリックしてカスタマイズできます。 「表示するフィールド」セクションには、結果ページにすでに表示されているフィールドが表示されます。 「使用可能なフィールド」セクションには、表示されていない残りのフィールドのリストが表示され...