配列をFASTA形式でコピー＆貼り付けし（1つまたは複数の配列を同時に独立して検索できます）、配列の種類（タンパク質/ヌクレオチド）を選択します。
必要に応じて、アドバンスト・パラメータを開きます。
ー MOTIF検索を行う
ー short input sequencesのBLASTアルゴリズムを変更する
― 配列を検索するデータベースを決定する（ヌクレオチド / タンパク質 / 特許公報 / 参考文献）
― 抽出するヒット数を増やす
すべてのパラメータを設定したら、「サーチ」を押します。
CDRの検索を行う方法
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