FASTA形式とは

FASTA形式は、ヌクレオチド配列またはアミノ酸（タンパク質）配列のいずれかを表すためのテキストベースの形式であり、ヌクレオチドまたはアミノ酸は1文字のコードを使用して表されます。 この形式では、配列名とコメントを配列の前に置くこともできます。 この説明行は「>」で始まり、配列に名前または一意の識別子を与えます。 追加情報が含まれている場合もあります。

より完全な例を以下に示します。 識別子、説明、および複数の配列が含まれています。

>sp|J7RUA5|CAS9_STAAU Start of CRISPR-associated endonuclease Cas9 OS=Staphylococcus aureus

MKRNYILGLDIGITSVGYGIIDYETRDVIDAGVRLFKEANVENNEGRRSKRGARRLKRRR

RHRIQRVKKLLFDYNLLTDHSELSGINPYEARVKGLSQKLSEEEFSAALLHLAKRRGVHN

VNEVEEDTGNELS

>sp|Q99ZW2|CAS9_STRP1 Start of CRISPR-associated endonuclease Cas9/Csn1 OS=Streptococcus pyogenes

MDKKYSIGLDIGTNSVGWAVITDEYKVPSKKFKVLGNTDRHSIKKNLIGALLFDSGETAE

ATRLKRTARRRYTRRKNRICYLQEIFSNEMAKVDDSFFHRLEESFLVEEDKKHERHPIFG

NIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLVDSTDKADLRLIYLALAHMIKFRGHFLIEGDLNPDNSD

VDKLFIQLVQT

>sp|G3ECR1|CAS9_STRTR Start of CRISPR-associated endonuclease Cas9 OS=Streptococcus thermophilus

MLFNKCIIISINLDFSNKEKCMTKPYSIGLDIGTNSVGWAVITDNYKVPSKKMKVLGNTS

KKYIKKNLLGVLLFDSGITAEGRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFSTEMATLDDAFFQ

RLDDSFLVPDDKRDSKYPIF

識別子は、英数字の_（アンダースコア）と-（ハイフン）で構成されます。 識別子にスペースを入れないでください。