Les structures de Markush ne sont pas indexées mais il peut être intéressant d'utiliser le dessin de Markush comme mode de recherche de dessin.
Prenons l'exemple d'un brevet traitant de l'"aspirine". L'indexation du module Chimie transformera le mot aspirine en la structure ci-dessous.
Il est possible pour un utilisateur de dessiner une structure de Markush (voir ci-dessous) pour rechercher une famille de structures incluant l'aspirine et trouver tous les documents résultants (incluant l'aspirine).
Le dessin de Markush ci-dessus peut être dessiné pour rechercher 6 molécules à la fois (en supprimant les composés symétriques), dont l'une est l'aspirine.
NB: procédure détaillée en pièce jointe.